根据安徽省卫生厅《关于公布安徽省“十二五”临床重点专科建设计划首批建设项目的通知》（卫科秘〔2013〕228号），阜阳市第二人民医院呼吸科和肝病科被安徽省卫生厅正式列入为“安徽省‘十二五 '  临床医学重点培育专科建设计划”。这标志着阜阳市二院学科建设提升到一个更高的层次和水平，进一步奠定了该院传染病防治能力的区域性龙头地位。

     阜阳市二院呼吸科自1972年建院以来，在“内外结合、防治结合、理论与实践相结合、临床与科研相结合”的方针指引下，经过周质胜、时建等省内知名专家的不懈努力和 40 多年的不断建设和发展，已经成为阜阳市呼吸系统疾病预防、治疗、教学、科研中心，同时也是阜阳市医学会呼吸病学分会、阜阳市医学会抗菌药物学分会的挂靠单位。科室由呼吸科门诊（含哮喘门诊、戒烟门诊和慢性咳嗽门诊）、病房、呼吸重症监护室、呼吸内镜室和肺功能室组成。现拥有主任医师 6 名，副主任医师 6 名；首届“江淮名医” 1 名，安徽医科大学硕士研究生导师 1 名，安徽医科大学和蚌埠医学院兼职教授 3 名，阜阳市呼吸病学科带头人 2 名，阜阳市专业技术拔尖人才 2 名，《临床肺科杂志》编委 2 人，《中华全科医学》编委 1人。自 2005 年以来科室先后承担国家级科研课题 2  项，省级科研课题 1 项，市级科研课题 12 项。获得《人感染高致病性禽流感的临床研究》等市级科技进步突出贡献奖 2 项，一等奖 1 项，二等奖 2 项，三等奖 3 项。主办国家级继续医学教育项目3项，省级继续医学教育项目 8 项。在慢性阻塞性肺病、支气管肺癌、支气管扩张、肺结核病、支气管哮喘、肺部感染、新发呼吸道传染病和呼吸重症方面具有丰富的临床经验和较高的学术造诣。开展的呼吸内镜下诊疗技术、急性呼吸衰竭机械通气技术和肺组织穿刺活检术等项目居全省同级医院领先水平。由于成绩突出，2000 年以来一直为“阜阳市临床医学重点学科”，2003 年曾被安徽省卫生厅命名的“安徽省临床医学市级重点学科”，2013 年被安徽省卫生厅命名为“安徽省‘十二五 '首批临床医学重点培育专科”。专科带头人：冉献贵、韩明锋。