结核病科是阜阳市临床医学特色学科，通过痰分枝杆菌培养+药敏试验，CT引导下经皮穿刺肺活检术，经气管镜冷冻、电凝、球囊扩张治疗支气管结核、经气管镜支气管粘膜下病变针吸活检术以及肺泡局部灌洗术等，提高了 难治性重症肺结核、耐多药肺结核、肺外结核及其伴有合并症的结核病 的鉴别诊断和治疗水平。2012年6月我院结核病科被国家疾控中心确定为全球基金耐多药肺结核免费治疗定点医院，对阜阳市辖区的耐多药肺结核病人提供24个月的免费治疗和复查，同时还为耐多药病人提供交通补贴和心理咨询服务。